The Evil Within 2 продолжает рассказывать историю Себастьяна Кастелланоса, который спустя несколько лет после завершения сюжета предыдущей части оставляет работу полицейского. В жизни героя случилось настоящее горе, он переживает гибель своей дочери Лили, которая, предположительно, умерла в результате пожара. Однако потом Себастьян узнает, что, вероятно, его ребенок жив, а потому бывший коп отправляется на поиски малышки.

Чтобы спасти Лили, герою потребуется отправиться в путешествие по виртуальному городе Юнинон, созданном искусственным интеллектом STEM. Внутри Себастьян встретит множество опасностей в лице мутировавших в монстров обитателей Юниона. Где-то в недрах цифрового кошмара его ждет родная дочка, и нам нужно помочь Кастелланосу добраться до нее и выбраться из западни, одолев всех противников по пути.