22-ой век, человечество вовсю осваивает космос, постепенно доказывая факт существования внеземных цивилизаций. Со временем люди установили дипломатические и экономические связи со многими пришельцами, интегрировавшись в их общество. Капитан Шепард, руководящий кораблем "Нормандия", стал руководителем целой группы космических авантюристов, которым вскоре предстоит взвалить на себя ответственность за всю галактику.

Во время выполнения важной мисси экипаж "Нормандии" вступает в конфликт с армией гетов - искусственной расы, созданной Жнецами. Узнав о том, какое будущее ждет все обитаемые миры, Шепард с командой должны остановить Жнецов и помогающего им Сарена - бывшего члена группы "СПЕТКР", пытающегося реализовать свои коварные планы.